家族５人、マイホームか賃貸か

幼いお子様３人を抱えての引越し大変かと思います。けれどもご主人も一緒に暮らせるようになると思うと安心ですね。
おっしゃる通り、東京は家賃も購入価格もかなり高くなってしまいます。ただ、エリアや都心からの距離によってかなり価格差があるので、家賃補助が出ている間に価格相場と環境をお調べになるのが良いかと思います。勤務場所にもよりますが、東京都内は高いので千葉や埼玉、神奈川も探す対象に入れた方が良いでしょう。
例えばJR総武線3LDK物件でみた場合、東京都内である亀戸駅だと賃料平均16.1万円、千葉県の幕張駅だと平均10.8万円です。中古戸建で見ると亀戸周辺で4000万円台〜、幕張周辺だと3,000万円台〜です。都内は戸建が少なく、徒歩圏だとなおさら高くなってしまいます。
無理なく返済できる金額からみた場合、毎月10万円返済で35年ローンとした場合、3500万円程度までなら無理なく返済できる範囲です。幕張周辺戸建が候補になりそうです。
返済可能金額はそれぞれの家庭によって全く違ってくるので、東京での生活が落ち着いてきたら、東京での生活費や今後の教育費等も考慮し、お子様３人が大学進学時でも無理なく返済可能かシミュレーションしてみることをお勧めします。また、将来お二人だけになった際に売却することを考えると、戸建よりも価格が下がりにくいマンションも候補に入れてみるのはいかがでしょうか。