副業で個人事業主の開業届を出した場合のメリット・デメリット

こんにちは。ご質問ありがとうございます。
副業につきましては相談文にお書きのとおり年間の所得（収入－経費）が20万円を
超える場合は確定申告が必要となります。
ただ、個人事業の事業として認められるには「事業の継続性」が求められます。
今後、コンスタントに事業として成り立ちそうなのかをよく考えてみられることを
お勧めします。
個人事業主として「開業届」を提出したとしても会社に知られることはありません。
会社に知られるとすれば「住民税」に関する事柄からです。
会社に知られないようにするには確定申告書の「住民税に関する事項」の欄で
「自分で交付」に○を付けます。こうすることで副業の収入に対する住民税の通知が相談者様の自宅に届くことになるので会社に知られずに済みます。
個人事業主として開業届を出せば65万円まで非課税とお書きですが、これは「青色申告」で尚且つ電子申告をした場合になります。
「青色申告」を選択するには青色申告を選択しようとする年の3月15日までに「青色申告承認申請書」を納税地の税務署に提出し、承認を受けなければなりません（年の途中の場合は開業の日から2ヶ月以内）。
「青色申告」は複式簿記で帳簿を作成する必要がありますのでご注意下さい。