確定申告の申請方法がなかなか理解できません

年末調整の意味を理解して貰うために、申告書を書かせているのだと思います。初めて聞きますが良い会社だと思います。
確かにあの申告書の形式（フォーマット）は初めての人には、分かりにくいと思います。
慣れれば何でもないのですが、用語がわからないので戸惑われるのは無理もないと思います。
申告書のフォーマットに記入する前に、所得税の概要を知った方が良いかもしれません。
① 所得には10の種類があること。　給与所得者（サラリーマン）は給与所得。今は、他は無視して良いでしょう。
② 所得は収入からその収入を得るために掛かった費用を差引きして貰えます。
　給与所得の場合は、個別の明細でなく、給与所得控除で一括差引きされます。
③ 収入から経費（給与の場合は給与所得控除）を差引きした金額から、所得控除を引きます。家族の多い人など、その他個人の事情に合わせて控除があります。
所得控除は17種類ありますが、よく適用されるのは
　基礎控除（48万円）、社会保険料控除、配偶者控除、医療費控除、生命保険料控除
　寄付金控除、の6つです。それ以外はネットで所得控除と検索すると出ます。
④ 　②から所得控除の合計を引くと課税所得です。
⑤ 課税所得に税率を掛けると税額が出ます。税率は5％～45％まで7段階です。
住民税は、課税所得に近い金額の10％です。
給与所得控除の金額は、給与額で変わりますが、計算式は給与所得控除で検索してください。
本屋で分かり易いと感じる本を選んで、読んでみてはいかがでしょうか。税金に詳しいとこれからの人生で得をします。